При кандидозі кишечника лікування проводиться препаратами, що не адсорбує з кишечника. Іншими словами, при виявленні кандиди в кишечнику, лікування такими протигрибковими засобами як Флуконазол, Інтраконазол, Кетоназол і Амфотерицин, невиправдано, оскільки ці препарати повністю адсорбуються в верхніх відділах шлунково-кишкового тракту і вже не потрапляють в товсту кишку.
Крім того, лікування кишкового кандидозу даними препаратами часто призводить до розвитку різних побічних ефектів, наприклад, токсичний гепатит, а позитивний результат або не досягається, або досягається тільки короткочасно.
А ось якщо при грибах кандида в кишечнику, лікування проводити Пімафуціна, ністатин або леворин, які є неадсорбуючого засобами і практично не всмоктуються з шлунково-кишкового тракту. Це дозволяє домогтися постійного високого вмісту їх активних речовин саме в просвіті кишечника. Однак і ці препарати мають свої побічні ефекти: токсичні ураження печінки, алергії і диспепсичні явища. При цьому Пімафуцин рідше викликає побічні ефекти, ніж Нистатин
Проблема в тому, що не всі препарати підходять для вагітних жінок і маленьких дітей з кандидозом кишечника. Як лікувати молочницю в такому випадку? Все той же Пімафуцин або як його ще називають Натамицин дозволений не тільки для вагітних або годуючих, а й для новонароджених, яким препарат призначають двічі на день по 100 мг. Для дорослої жінки денна доза повинна бути в 2 рази більше, при цьому за 1 прийом не можна приймати більше 100мг. Інакше кажучи, збільшується не разова доза, а кількість прийомів ліки в день (з двох до чотирьох).
В незалежності від обраного адсорбуючого препарату середня тривалість прийому ліків становить близько 10 днів.
Лікування кандидозу кишечника у жінок і чоловіків направлено в першу чергу на усунення факторів, що сприяють розвитку молочниці, а потім на відновлення нормальної мікрофлори шлунково-кишкового тракту. Тому при грибку кандида в кишечнику, лікування буде включати в себе не тільки протигрибкові засоби, але і біфідобактерії. Біфідобактерії створюють природні умови для розмноження і відновлення балансу мікрофлори на основі підживити корисними речовинами епітелію ураженої слизової. Саме використання біфідобактерій дозволяє в більшості випадків, після успішного лікування антимикотиками, запобігти розвитку реінфекції.